Указом президента Азербайджанской Республики от 30 марта 2023 года № 2074 в целях совершенствования управления водными ресурсами, водного хозяйства и мелиорации, эффективного использования водных ресурсов, улучшения организации работ по мелиорации и ирригации земель на базе Государственного агентства водных ресурсов Министерства по чрезвычайным ситуациям Азербайджанской Республики агентство водных ресурсов создано, В подчинение агентства передано имущество открытого акционерного общества "Азерсу" и открытого акционерного общества мелиорации и водного хозяйства Азербайджана.
Указом Президента Азербайджанской Республики от 17 ноября 2023 года № 2356” о ряде мер по обеспечению деятельности Государственного агентства водных ресурсов Азербайджана " были созданы аппарат и региональные подразделения Службы государственного контроля за использованием и охраной вод и включены в структуру Агентства государственных водных ресурсов Азербайджана.
В соответствии с пунктом 1 Положения о службе государственного надзора за использованием и охраной вод при Агентстве государственных водных ресурсов Азербайджана, утвержденного Указом Президента Азербайджанской Республики от 29 июля 2024 года № 163, служба должна соблюдать правила пользования и охраны водных объектов, лимиты водопользования, санитарно-гигиенические, экологические, санитарно-гигиенические, санитарно-гигиенические, к нормативным правовым актам, предусматривающим гидрогеологические, гидрологические, технологические требования, организация, осуществляющая государственный контроль за режимом использования территории водоохранных зон и соблюдением иных требований водного законодательства Азербайджанской Республики, мониторинг водных и водохозяйственных объектов.
